Simultaneamente com as buscas na região de Stavropol, uma série de buscas ocorreu em Karachay-Cherkessia

Em 20 de setembro de 2016, o Departamento de Guarda de Fronteira do FSB para Karachay-Cherkessia realizou 4 buscas ("exames") nas casas das Testemunhas de Jeová nas aldeias de Mednogorsky e Kurdzhinovo.

Os mandados de busca foram emitidos por I. Gerbekov, juiz da Suprema Corte do KChR, sob o argumento de que uma das fiéis, Svetlana Isaeva, que mora em Mednogorskoye, está envolvida em envolver outras pessoas em sua religião e, supostamente, distribuiu livros incluídos na lista de materiais extremistas entre seus semelhantes, que também foram revistados.

Uma semana depois das buscas, um oficial do FSB voltou a Isaeva e exigiu que ela mudasse seu depoimento e admitisse que estava distribuindo literatura extremista. Isaeva recusou, pois isso não é verdade.